孙小天、东方陌、谛听和杨九鲤四人一路西行来到黑骨山附近的梨花城，刚进城内，四人便引起了骚动。原来百年前，此地曾是繁华的小满国，黑风法师与国后通奸被杀，死后怨气颠覆整个国度，一时间尸横遍野，小满国化为黑骨山，唯有梨花城幸免于难。从此梨花城内保持着男女不能公开交往的习俗，东方陌、杨九鲤公然并肩行走触犯了禁忌。为免伤及无辜，神猴一行人找到传说中的“黑风老妖”，没想到竟是一名柔弱美丽的女子苏落樱。她是黑风老妖与国后的私生女，本为死胎，因被黑风老妖注入怨气存活了下来。孙小天想帮助苏落樱化解体内的怨气，而东方陌则认为

影片讲述了神猴孙小天因一场突如其来的神秘大火意外来到十年后的世界，费劲力气摆脱迷妹史飘飘的纠缠后，却发现曾经的他早已葬身火海，好友谛听黑化成魔，与老搭档东方陌、杨九鲤反目成仇，形同陌路……所有人都在等待救世主孙小天的出现……

苏州城内万妖割据，法师保护百姓，与妖族对立，然一夜之间，随着不明身份的千年青蛇突现，众妖神秘死亡，人类也惶惶不可终日。新晋法师樊海出手降妖，却意外发现了众妖围剿千年蛇妖的秘密。一时间，苏州城风起云涌，暗藏在“和平”背后的惊天阴谋浮出水面……

集人间怨气的魔头妖祖即将现世，为了打败他拯救苍生，东方陌、谛听和功德掌门三人四处寻找身为神猴的化身——孙小天。与此同时，妖祖觊觎封印在神猴体内的两大神器，为了抓住孙小天，孙小天的父母被妖祖残忍杀害，大富之家孙府一夕之间家破人亡。凭借着超乎常人的意志力和我命由我不由天的乐观精神，失去法力和记忆的凡人孙小天一路砥砺前行，重拾本领。起初为亲人复仇，继而为天下大义，战魔头，驱妖邪。天将降大任，道阻且长，救世主孙小天的使命才刚刚开始……

九重天坍塌，九通猿猴借众神补天不在其位之际，命妖界找寻三大神器。万妖窟公主玉冰心夜袭周元城，威逼不周山山神周玉关交出三大神器之一的撑天柱，周玉关前往踏梅弱水囚牢求请五百年前被关押在此的神猴相助，不料神猴早已厌世。周玉关救下被典狱司暗下杀手的神猴，自己魂飞魄散。周玉关的牺牲令神猴动容，决定闯出弱水前去救百姓。地藏菩萨出手助他，并派遣谛听跟随在其左右监督神猴。二人赶至周元城，击败玉冰心救下了百姓。